国家纳米科学中心马拉松协会成立于2009年，是隶属于中心团委和学生会管理的体育社团。马拉松协会秉承马拉松永远向前的精神，以推广科学健康的长跑运动为宗旨，是广大长跑运动爱好者的温暖团体。

在2011年，除了组织每周定期的训练外，还组织研究生参加了北京马拉松赛、清华大学长跑节、耐克10公里等活动。为了便于交流，及时公布相关动态，现在人人网建立主页（http://page.renren.com/601013983），欢迎大家前来交流。